ยูกิมูระ ชิซึรุ เป็นลูกสาวของแพทย์ที่ทำงานในเอโดะ พ่อของเธอออกจากเอโดะไปทำงานเป็นแพทย์อาสาสมัครและย้ายไปเกียวโตโดยไม่ได้พาลูกสาวไปด้วย เมื่อเวลาผ่านไป ชิซึรุเริ่มกังวลเกี่ยวกับการขาดการติดต่อกับพ่อของเธอ ดังนั้นเธอจึงตัดสินใจไปเกียวโตเพื่อตามหาเขา ระหว่างทาง ชิซึรุถูกโจมตีโดยกลุ่มอาชญากร และได้เห็นการต่อสู้ระหว่างปีศาจกับชินเซ็นกุมิ หลังจากช่วยเหลือและจับตัวเธอไว้ ชินเซ็นกุมิก็ปรึกษาหารือกันว่าจะทำอย่างไรกับชิซึรุ จนกระทั่งพบว่าเธอเป็นลูกสาวของหมอที่พวกเขากำลังตามหาอยู่เช่นกัน ดังนั้นพวกเขาจึงตัดสินใจเป็นผู้คุ้มครองชิซึรุและช่วยเธอตามหาพ่อของเธอ (หมอ) เหตุการณ์มากมายเกิดขึ้นระหว่างที่เธอพักอยู่กับชินเซ็นกุมิ ทั้งการค้นพบความลับลึกลับและการต่อสู้กับกลุ่มบาคุมัตสึ