2030, Tokyo, Chihiro è stato adottato dalla famiglia Doumyouji e viene trattato da Kotetsu come un fratello; studenti universitari, Chihiro studia letteratura inglese ed ha una smisurata passione per Shakespeare; i ragazzi inoltre aiutano il padre a gestire un dojo di kendo. Un giorno mentre sono nel campus universitario, una risonanza ad alta frequenza accompagnata da una nebbia rossa rende incosciente l'intera popolazione di Tokyo. Il governo sospettando un virus sconosciuto, mette Tokyo in quarantena. Entro una settimana dall’evento gli abitanti della capitale riprendono coscienza, solo Chihiro rimane incosciente molto più a lungo. Tutti si sono risvegliati apparentemente illesi, ma il panorama cittadino è mutato, è invaso da enormi radici, e intorno all’area urbana persiste la misteriosa nebbia rossa, che ora impedisce a chi vive entro il suo perimetro di uscirne. Molti degli abitanti però iniziano a sviluppare poteri sovrannaturali derivanti dal loro stesso sangue e mutazioni.