Mød Nemo, en ung og nysgerrig klovnfisk, der bliver fanget af en sportsdykker og ender i et akvarium på en tandlægeklinik i Sydney. Hans ængstelige far, Marlin, begiver sig ud på en farefuld redningsmission sammen med den hjælpsomme, men meget glemsomme kirurgfisk Dory. På deres rejse møder de hajer, havskildpadder, gopler, sultne måger og mange andre udfordringer. Samtidig lægger Nemo og de andre akvariefisk en dristig plan for at slippe fri og vende tilbage til havet.